Euroopan komission varapuheenjohtaja on Euroopan komission salkkukomissaarien työtä koordinoiva johtaja. Varapuheenjohtaja varmistaa, ettei komissaarien suunnitelmat ole keskenään ristiriitaisia.[1] Komissaarit muodostavat yhdessä komission puheenjohtajan kanssa Euroopan komission, yhden EU:n toimielimistä.[2]
Varapuheenjohtajia on yhteensä kahdeksan, joista kolme on nimitetty johtaviksi varapuheenjohtajiksi.Euroopan komission puheenjohtajaehdokas valitsee mahdolliset varapuheenjohtajat EU-maiden tekemisen ehdotusten perusteella.[2]